日据时期的1907年，日本人拆除台北开府所建的官立孔庙，庙器尽毁。及至1925年，作为台北士绅的陈玠甫曾祖父陈培根与鹿港辜家等发起倡议集资捐地，兴建民间孔庙。新庙选址于素有“五步一秀、十步一举”美誉的大龙峒地区，还请来曾主持修建台北艋舺龙山寺、新竹城隍庙的泉州名匠王益顺担纲设计，营建风格端庄华丽。
